醫(yī)院前身為合肥基督醫(yī)院，始建于1898年，歷經(jīng)風(fēng)雨洗禮，已發(fā)展成為一所設(shè)備先進(jìn)、專(zhuān)科齊全、技術(shù)力量雄厚，集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、保健、康復(fù)、急救為一體的省級(jí)大型三級(jí)甲等綜合性醫(yī)院。在最新一輪（2019年度）全國(guó)三級(jí)公立醫(yī)院績(jī)效考核排名第24位，等級(jí)A+；連續(xù)四年進(jìn)入“復(fù)旦版中國(guó)醫(yī)院排行榜”全國(guó)百?gòu)?qiáng)，健康管理中心排名全國(guó)第2；5個(gè)學(xué)科進(jìn)入全國(guó)榜單，27個(gè)學(xué)科進(jìn)入華東榜單。共開(kāi)放床位5750張，設(shè)有47個(gè)臨床醫(yī)技學(xué)科。2021年集團(tuán)門(mén)診量582萬(wàn)人次，出院32萬(wàn)人次，手術(shù)17.9萬(wàn)臺(tái)次，平均住院日6.81天。

醫(yī)院由中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)與安徽省衛(wèi)生健康委員會(huì)雙重管理，以中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)管理為主。目前總占地面積（含規(guī)劃面積）785畝，總建成面積61.7萬(wàn)平方米，總在建面積（不含規(guī)劃建筑面積）54.9萬(wàn)平方米。規(guī)劃建筑面積35萬(wàn)平方米。實(shí)行“一院多區(qū)”集團(tuán)化、一體化和差異化發(fā)展戰(zhàn)略，由總院（院本部）、南區(qū)（安徽省腦科醫(yī)院、安徽省心血管病醫(yī)院）、西區(qū)（安徽省腫瘤醫(yī)院）、感染病院（合肥市傳染病醫(yī)院）組成，正在建設(shè)濱湖和北城院區(qū)。獲批國(guó)家創(chuàng)傷區(qū)域醫(yī)療中心和國(guó)家緊急救援基地建設(shè)項(xiàng)目。與73家縣市級(jí)醫(yī)院和社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心組建了醫(yī)療聯(lián)合體，全面托管長(zhǎng)豐、樅陽(yáng)、渦陽(yáng)縣人民醫(yī)院建立緊密型醫(yī)聯(lián)體，共建包河區(qū)望湖城社區(qū)醫(yī)療服務(wù)中心，牽頭成立了37個(gè)專(zhuān)科聯(lián)盟，牽頭組建了覆蓋省內(nèi)外60余家醫(yī)院的遠(yuǎn)程醫(yī)療協(xié)作網(wǎng)。 

現(xiàn)有在職職工7221人，其中高級(jí)職稱(chēng)1116人。擁有特聘院士6人，國(guó)家重點(diǎn)人才項(xiàng)目專(zhuān)家13人，省級(jí)重點(diǎn)人才項(xiàng)目專(zhuān)家15人，一級(jí)主任醫(yī)師39人；國(guó)務(wù)院及省政府津貼專(zhuān)家124人次，江淮名醫(yī)59人次，省學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人及后備人選118人次。獲批國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科建設(shè)項(xiàng)目8個(gè)，省臨床重點(diǎn)專(zhuān)科25個(gè)，其中優(yōu)先發(fā)展10個(gè)，重點(diǎn)專(zhuān)科10個(gè)，培育專(zhuān)科3個(gè)；安徽省“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)7支。

著力提升醫(yī)療技術(shù)，形成了以器官移植、心腦血管疾病為代表的疑難重癥救治技術(shù)，以介入、腔鏡為代表的微創(chuàng)技術(shù)。入選2項(xiàng)國(guó)家疑難病癥診治能力提升工程項(xiàng)目（腦血管和腫瘤方向）。國(guó)際率先創(chuàng)新開(kāi)展單孔胸腔鏡肝切除術(shù)，精準(zhǔn)肝切除術(shù)、腹腔鏡肝膽手術(shù)等技術(shù)國(guó)內(nèi)領(lǐng)先，微創(chuàng)肝膽技術(shù)在省內(nèi)廣泛推廣；最新一代Xi達(dá)芬奇機(jī)器人手術(shù)在普外科、泌尿外科、胸外科等多科室廣泛應(yīng)用；目前是全國(guó)為數(shù)不多、安徽省唯一一家擁有心臟、肺臟、肝臟、腎臟、胰腺、小腸、角膜等全部器官（組織）移植資質(zhì)的醫(yī)院，肝移植技術(shù)和理念不斷取得新的突破，親屬間活體腎臟移植連續(xù)多年位居全國(guó)前3，肺臟移植例數(shù)居全國(guó)第12；臍血造血干細(xì)胞移植技術(shù)進(jìn)入國(guó)際先進(jìn)行列；獨(dú)創(chuàng)的側(cè)臥位下直接前方入路髖關(guān)節(jié)置換技術(shù)（LDAA）、股骨近端重建技術(shù)在國(guó)內(nèi)外廣泛推廣；腦深部刺激術(shù)（DBS）治療帕金森病等運(yùn)動(dòng)障礙性疾病、“四聯(lián)療法”治療三叉神經(jīng)痛等特色技術(shù)國(guó)內(nèi)領(lǐng)先；心血管內(nèi)科CRT技術(shù)治療嚴(yán)重心力衰竭連續(xù)多年手術(shù)量全國(guó)領(lǐng)先；心臟外科右側(cè)肋間小切口胸腔鏡輔助下二尖瓣主動(dòng)脈瓣聯(lián)合置換術(shù)等技術(shù)全國(guó)領(lǐng)先；糖尿病領(lǐng)域的研究和治療領(lǐng)跑全國(guó)；成為全國(guó)僅有的5家獲得質(zhì)子放射治療系統(tǒng)準(zhǔn)予許可單位之一，啟動(dòng)質(zhì)子系統(tǒng)臨床試驗(yàn)。揭牌“泛血管疾病管理中心”，掛牌國(guó)家“示范高級(jí)卒中中心”和“中國(guó)胸痛中心”。